科学研究

科学研究 学术动态

杨光教授课题组在Nature Communications发表论文揭示长江江豚的独立物种地位

永盛彩票 www.cwrzt.com

近日,我校生命科学学院杨光教授课题组联合哈佛医学院、加州大学伯克利分校与华大基因开展中国水域江豚的种群基因组学研究,相关成果于2018年4月10日在线发表于《自然·通讯》(Nature Communications)。该研究通过全基因组的测定与比较分析,从种群遗传结构、历史动态和适应性进化等方面系统地揭示了江豚不同种群之间的显著差异与适应性分化,提出生活在长江中下游的长江江豚具有独立的物种地位。

长江江豚仅分布于长江中下游,是全世界唯一的江豚淡水种群。随着白鱀豚的功能性灭绝,长江江豚已成为长江中唯一的淡水豚类。然而,近年来由于环境污染、船舶运输、非法捕捞、采砂、沿岸工程建设等人为影响,其种群数量持续衰退,目前仅剩1000头左右。若不加强对该物种的?;?,将步白鱀豚的后尘而面临极高的灭绝风险。杨光教授课题组通过测定48个江豚个体的全基因组序列并进行生物信息学挖掘和分析,发现种群结构分析和系统发育重建揭示了长江江豚组成单独的进化支系,与其他江豚种群已不存在基因交流?;诒匆端挂蜃?Bayes factor)分析强烈支持长江江豚的独立物种地位,其物种分化受到末次盛冰期LGM(Last Glacial Maximum,距今约2.65至2万年)的影响。虽然不同长江江豚与海洋江豚之间的分化时间不长,但在一系列与渗透调节相关的基因(如与肾脏水稳态、加压素调节的水重吸收,尿素转运等有关的基因ADCY1、DYNC2H1和SLC14A2,及与肾素-血管紧张素系统功能相关基因ACE2等)检测到明显的正选择作用,提示长江江豚已经对不同于海洋的淡水环境产生了适应性进化,从而提示长江江豚与海洋江豚之间已经出现了生殖隔离和物种分化。

长江江豚与海洋江豚的显著分化及其独立物种地位的揭示,将进一步凸显长江江豚在长江生物多样性与生态系统?;ぶ械钠旖⑽镏值匚?,进一步加强该物种的?;そ哂屑厥獾闹匾院捅匾?。

该项研究得到了国家杰出青年科学基金、国家自然科学基金项目重点项目、国家重点研发计划课题等的支持。南京师范大学的孙迪博士、徐士霞教授、哈佛医学院的周旭明博士以及华大基因光宣敏为论文的共同第一作者,南京师范大学杨光教授、加州大学伯克利分校Rasmus Nielsen教授和华大基因方晓东博士为论文共同通讯作者。

论文链接:https://www.nature.com/articles/s41467-018-03722-x

部分媒体报道:

https://phys.org/news/2018-04-porpoise-gene-river-pig-unique.html

https://www.zmescience.com/ecology/animals-ecology/yangtze-river-porpoise-unique-living-freshwater-special-genetic-adaptations/

http://url.cn/5cVwU0V

生科院 供稿

发布时间:2018/04/11